Поделка штатного расписания...

Не очень понятно зачем это сделано... Если была фиксированная зарплата, еще постоянная, то именно с размера этих сумм платились налоги в бюджет. Т.е. с вашей з/п удерживался НДФЛ-13%- за ваш счет,(например оклад 10 тыс- НДФЛ-13%, на руки выдается 8700,00), остальные обязательные налоги= ПФР-накопительная, ПФР страховая, ФФОМС, ФСС и НС- работодатель обязан платить ежемесячно с начисленных сумм. Если вам занизили зарплату в штатном расписании, то как же тогда размер налоговых перечислений? Их то никак нельзя занизить, ибо они уже должны быть уплачены. Вам нужно обратиться в ваш пенсионный фонд с запросом какие отчисления производились на вас за время работы в этой организации. Это просто сделать, нужно просто позвонить в пенсионный, проконсультироваться как это сделать правильно- по письменному запросу или просто на приеме и все. Когда будут на руках размеры этих налогов, будет понятно какие суммы дохода вообще работодателем показывались, если вообще показывались) Это и будет вашим доказательством в судебном или до судебном споре с руководством. Только так. А факт подмены штатки как вы докажете? Штатку можно хоть каждую неделю менять, в связи с производственной необходимостью. Налогов отчисление проверяйте.