Как поступить работодателю по закону в данной ситуации?

Если этот сотрудник "в списках значится", т. е. трудоустроен официально - есть трудовой договор, приказ о приеме, на него с первого дня велся табель и начислялась зарплата, то уволить его за прогулы невозможно. ведь у вас нет фактов того, что работник именно прогуливает. вот уволите вы его, а он на следующий день явится и предоставит больничный лист или повестку военкомата о прохождении военных сборов - что тогда? восстановление на работе, оплата б/л или выполнения гос. обязанностей. да и уволить работника, отсутствующего на работе, нельзя (ст. 84.1. тк рф) . так что во всех случаях вам придется дождаться его выхода на работу, а сколько это будет - неизвестно. но если вы случайно узнаете, где его можно встретить, то лучше всего уговорите его черкануть на клочке бумаги пару строк об увольнении по собственному желанию. это снимет все проблемы и избавит вас от кадрового балласта.