Если в трудовом договоре есть дополнительный пункт:о том,что ,если я уйду,надо оплатить два оклада, типа за обучение !

Трудовой договор не может быть одновременно ученическим, это 2 разных договора. Ученический обычно является дополнительным к трудовому. Чтобы возмещать какую-то сумму за обучение, у организации во-первых должна быть лицензия на оказание образовательных услуг, во-вторых с Вами должен быть заключен ученич. договор, в котором прописывается, чему конкретно Вы обучаетесь, причем программа обучения должна быть из списка утвержденных организацией программ обучения.