Как оплачивается прогул работника по уважительной причине? какой приказ при этом издается?

Никак. и ещё по уважительной причине прогулов не бывает. можно отсутствовать по уважительной причине. а прогул - это прогул. средний заработок за работником сохраняется если он отсутствовал на рабочем месте если он донор и ему положен отдых если выполнял обязанности арбитражного заседателя если участвовал в профсоюзных мероприятиях если призван на сборы если в учебном отпуске в любом случае, работодатель должен быть предупрежден заранее.