Есть ли какой-то лимит на штрафные вычеты из заработной платы?

Возьмите копию приказа и идите в суд. Приказ "на штраф" послужит доказательством, что Вы состоите в трудовых отношениях с работодателем (плюс пара свидетелей). При наличии веских доказательств суд может признать Ваши отношения трудовыми на основании ст.16 ТК РФ: "Трудовые отношения между работником и работодателем возникают также на основании фактического допущения работника к работе с ведома или по поручению работодателя или его представителя в случае, когда трудовой договор не был надлежащим образом оформлен." А далее - все вытекающие из ТК последствия... Оп!(решение суда) - и Вы официально трудоустроены!