Могут ли пропущенные по уважительной причине рабочие часы идти в счет отпуска без сохранения заработной платы?

Таких норм в ТК РФ нет, если это прописано в Положении о рабочем времени предприятия т соответственно это так же не законно, но "прихоти" директоров, особенно частных компаний границ не ведают, труд инспекция Вам поможет, только буде готовы потом правильно работать, люди в России сильно темпераментные. Удачи.