Могут ли уволить за прогул, если уже написал заявление по собственному желанию и отрабатываешь 2 недели.

Такие вопросы возникают у всех, кто считает подачу заявления на увольнение приобретением какого-то особого "статуса увольняемого", а время до дня фактического увольнения - "отработкой". Ничего этого не происходит. Даже если в день увольнения (последний день работы) вы будете отсутствовать на работе 4 часа 1 минуту и более, то запросто можете быть уволены за прогул, а если на радостях примите на грудь - то за пьянку (п/п "а" и"б" п.6 части первой ст. 81 ТК РФ). Настоящее право оставить работу вы получите только после 24 часов последнего дня работы, а фактически - после времени окончания рабочего дня вашей организации в последний день работы (ст. 14 ТК РФ, ст.193 и 194 ГК РФ)