Может ли работодатель уволить меня по истечению трудового договора если я буду находиться в декретном отпуске?

По общему правилу работодатель не может уволить беременную работницу, даже если закончился срок действия срочного трудового договора (за исключением случаев, когда беременная женщина исполняла обязанности отсутствующего работника, и он вышел на работу, а перевести её некуда).
в вашем случае, если дата окончания отпуска по бир будет позже даты окончания договора, договор должен быть продлен до окончания отпуска по беременности и родам (ч. 1, 2 ст. 261 тк рф).
так что, работодатель должен:
1. продлить срок вашего договора до окончания отпуска по беременности и родам, получив от вас соответствующее заявление и заключив соглашение о продлении договора на осн. ч. 2 ст. 261 тк рф.
2. уволить вас по окончании отпуска по беременности и родам, предварительно уведомив вас об этом не менее, чем за 3 дня.