Начальство настаивает чтоб мы написали заявление по собственному желанию задним числом

Судя по его поступкам, он человек непорядочный: и действия по отношению к сотрудникам незаконные, и черная бухгалтерия, и уход от налогов. Эти действия уголовно наказуемы. Если напишите заявления по собственному, потом ничего не докажете. Пишите заявления в прокуратуру. В прокуратуре есть целые отделы и направления по нарушению трудового законодательства. Этот хитрец скорее всего имеет "карту в рукаве": если не согласитесь добровольно, он вам прогулы оформит или еще какую пакость сотворит. Не тяните время. Его запугивать, грозить - только оттягивать "удовольствие", сейчас не уволит, потом отомстит за шантаж. Так что действуйте законным путем. Посоветуйтесь с местными юристами. Если он вас уволит без вашего согласия, надо обращаться в суд со всеми документами. Обычно суд обязывает на рабочем месте восстановить и выплатить зарплату за все "прогулянные" не по вашей вине дни и месяцы. Я не знаю вашей конкретной ситуации. Возможно, с вами даже никаких договоров или контрактов не заключалось. Это вообще "труба". Обратитесь к юристам!