А можно уволить сотрудника? в данном случае?

Случаи, когда работодатель может уволить работника, перечислены в статье 81 тк рф.
ваш случай к ним не относится.
если предприятию нанесён ущерб, то по данному факту должна быть проведена служебная проверка, в ходе которой установлены виновные и размер ущерба.
если будет установлена вина работника, то его вправе привлечь к материальной ответственности в пределах среднемесячного заработка (либо полностью, если ущерб причинен в результате умысла, преступных действий и т. д.).