Идут ли отчисления в Пенсионный Фонд , если я работаю по гражданско - правовому договору ?

Вообще-то, в соответствии со ст.5 гл.2 федерального закона №212-фз от 24.07.2009 г., страхователь (лицо, заключившее с вами договор) обязан уплачивать страховые взносы в ПФ и мед.фонды за подрядчиков - физ.лиц, точно так же, как и за наемных (работающих по трудовому договору) работников.