Работник имеет явные признаки заболевания с которым не должен выполнять данную работу.

Пошлите его на внеочередную медкомиссию в другую поликлинику. если работник работает во вредных условиях труда, то вы вправе требовать, чтобы он шел только в поликлинику, с которой вы заключили договор. никакие разрешения комиссии за свой счет можете не принимать. вы его туда не посылали, это его личное обследование по желанию.