Я устроилась на работу в бюджетную организацию за 1,5 месяца до ухода в отпуск по беременности и родам.

Видимо, организация не смогла доказать соцстраху, что вы ценный работник, и почему вас взяли на работу на такой короткий срок (особенно, если ранее вы нигде не работали и после вашего ухода в декрет на эту должность больше никого не приняли). и соцстрах решил, что вы таким образом пытаетесь незаконно "обогатиться" за счет государства.

на основании п. п. 3 п. 1 ст. 11 закона № 165-фз страховщики имеют право не принимать к зачету расходы на обязательное социальное страхование, произведенные с нарушением законодательства рф.
следовательно, чтобы ответить на ваш вопрос, нужно выяснить, является ли рассматриваемый случай нарушением законодательства.
официальных разъяснений контролирующих органов по данному вопросу нет. но судя по арбитражной практике, территориальные органы фсс рф явно усматривают в аналогичных ситуациях злой умысел.