Можно ли перечислять зарплату сотруднику за вычетом ранее допущенной ошибки?

Нет, нельзя. больничный вы обязаны выплатить полностью. вы должны были в течении месяца доказать счетную ошибку и истребовать излишнюю сумму с работника, месяц прошел, сумму уже вернуть не получится, любой суд откажет.
трудовое законодательство содержит норму, согласно которой излишне выплаченная заработная плата может быть взыскана с сотрудника только в следующих случаях:
- при расчете заработной платы была допущена счетная ошибка;
- доказана вина сотрудника в невыполнении норм труда или в простое;
- излишняя выплата денег произошла в связи с неправомерными действиями самого работника (этот факт должен установить суд).
в остальных случаях излишне уплаченная зарплата возврату не подлежит.