Как оформить в трудовом договоре дистанционного сотрудника на постоянной основе, но для временных работ?

Если вы хотите оформить сотрудника "на постоянной основе", то это уже будет ваш постоянный сотрудник. а значит и трудовой договор должен быть заключен на неопределенный срок. режим рабочего времени можно указать в самом договоре или в приложении к нему. рабочие дни сотруднику проставляйте в табеле те, когда он фактически работает, т. е. находится в командировке, пусть даже это будет всего несколько дней. оплата труда будет по фактически выполняемой работе+командировочные расходы.