Работник обратился в суд об отмене дисциплинарного взыскания

Суд, с большой вероятностью, признает приказ неправомерным, т. к он вынесен с нарушением процедуры привлечения к дисциплинарной ответственности. так же будет учитываться и соразмерность между проступком и наказанием за него.
если мелочь какая - миритесь... дисциплинарное взыскание в виде замечания или выговора может быть снято в любой момент
если проступок серьезный и готовы рисковать и судиться, то постарайтесь хотя бы "обложиться" документами. приказ об истребовании письменного объяснения должен быть. если нет, то издать нужно. если нет объяснительной - состряпайте акт об отказе работника в предоставлении объяснения (отсутствие объяснительной от работника не является основанием для невынесения дисциплинарного взыскания). акт о совершении дисциплинарного проступка должен быть. если не было - стряпайте и составляйте акт об отказе в ознакомлении работника с этим актом и т. д. и т. п.
только в этом случае никаких гарантий...