Устроился на завод учеником на чпу. получаю стипендию 6 тысяч заключил договор.

Если вы поняли это , еще будучи учеником, т.е. во время действия ученического договора (ст. 198 ТК РФ), то уходите как можно скорее, до завершения курса обучения. Тогда вам платить ничего не придётся. Но если вы завершите курс обучения и получите специальность "оператор чпу" (сдав экзамен и получив документ) - вот тогда и придётся отрабатывать тот самый год (ст. 207 ТК РФ). Стоимость курса обучения определяет ваш работодатель - это вам подскажут в плановом отделе или в бухгалтерии