Какое положение запрещает пребывание работника на рабочем месте в нерабочее время ?

Такой запрет может содержаться только в локальных нормативных актах работодателя (коллективном договоре, правилах внутреннего трудового распорядка, трудовом договоре и т.п.) Но тогда и работник при любой необходимости продолжения работы сверх установленного времени может потребовать распоряжения в письменном виде, ссылаясь на то, что "пребывание работника на рабочем месте в нерабочее время" будет являться дисциплинарным проступком. А имея на руках письменное распоряжение о работе сверх установленного времени (хотя бы в виде записки от мастера, бригадира, нач. отдела и т.п.) всегда можно потребовать через суд оплаты сверхурочной работы. В данном случае работодатель за что боролся - на то и напоролся.