Нужно ли заключать договор индивидуальной материальной ответственности с оператором склада?

Обязанности такой нет, есть лишь возможность их заключения. смотрите сами входит должность в перечень или нет.
тк рф статья 244. письменные договоры о полной материальной ответственности работников
письменные договоры о полной индивидуальной или коллективной (бригадной) материальной ответственности (пункт 2 части первой статьи 243 настоящего кодекса), то есть о возмещении работодателю причиненного ущерба в полном размере за недостачу вверенного работникам имущества, могут заключаться с работниками, достигшими возраста восемнадцати лет и непосредственно обслуживающими или использующими денежные, товарные ценности или иное имущество.
перечни работ и категорий работников, с которыми могут заключаться указанные договоры, а также типовые формы этих договоров утверждаются в порядке, устанавливаемом правительством российской федерации.
постановление минтруда рф от 31.12.2002 n 85 "об утверждении перечней должностей и работ, замещаемых или выполняемых работниками, с которыми работодатель может заключать письменные договоры о полной индивидуальной или коллективной (бригадной)...
http://www.consultant.ru/document/cons_doc_law_40830/d89302400c6141c38781718a93294392a177187c/