Можно ли поставить отметку в трудовой

Вы вправе это сделать, поскольку вы являетесь учредителем ООО, а значит можете стать и его работником - от генерального директора до сторожа и дворника. В графу 1 ТР/КН внесите порядковый номер записи, в графу 2 - число месяц и год начала работы в вашем ООО, в графу 3 - наименование вашего ООО (как заголовок посередине, можно поставить штамп), а затем - наименование вашей должности "Принят....", в графе 4 - дату и номер учредительного документа ООО. Трудовой стаж у вас будет, но не будет страхового, поскольку в этот период вы не делали отчислений в ПФР.