Можно обратиться в какую нибудь службу по задержки зарплаты,если на руках только договор по выполнению подрядных работ?

Договор подряда вообще не подразумевает выплату заработной платы. вознаграждение по договору подряда выплачивается на основании закрытого, т.е. подписанного сторонами акта выполненных работ. ну и что, что договор у вас на руках. а может вы договор заключили, а работы не выполнили. если у вас есть доказательство того, что работы выполнены, то можете подать на заказчика в суд. в Гострудинспекцию ходить бесполезно, этот договор с трудовыми отношениями ни чего общего не имеет.