Технический директор (соучредитель) не сдавала трудовую, но через суд требует вернуть. как доказать что не сдавала ?

Доказать можно только обратное - получение ТР/КН от работника при приёме на работу и запись об этом в "Книге учета движения трудовых книжек и вкладышей в них". Если вы не потребовали ТР/КН от работника при приёме на работу и не выдали работнику по его заявлению новую ТР/КН, как того требует ст. 65 ТК РФ - значит вы нарушили ст. 66 ТК РФ. И работник может сейчас "вешать" на работодателя всё, что угодно - утерю, порчу, задержку выдачи ТР/КН, а суд примет его сторону. Со всеми, вытекающими отсюда последствиями.