Гл. бухгалтер ушла в отпуск. Можно ли на время ее отпуска с ней же заключить граж-правов. договор? на те же функции.

Почему же нельзя? Можно. Заключите договор оказания услуг по ведению бухгалтерского учета. Только отношения уже.будут не трудовыми, то есть подчиняться правилам внутреннего трудового распорядка уже не будет, не обязан вовремя приходить на работу, уходить может в любое время и т.п.