Замена годов при начислении больничного по бир

Бухгалтерия не права.
согласно ч. 1 ст. 14 фз-255 - в случае, если в двух календарных годах, непосредственно предшествующих году наступления .. страховых случаев, либо в одном из указанных годов застрахованное лицо находилось в отпуске по беременности и родам и (или) в отпуске по уходу за ребенком, соответствующие календарные годы (календарный год) по заявлению застрахованного лица могут быть заменены в целях расчета среднего заработка предшествующими календарными годами (календарным годом) при условии, что это приведет к увеличению размера пособия.

то есть, имеет значение лишь тот факт, что в предыдущие 2 года вы находились в отпусках по уходу за ребенком и по бир, и не имеет значения, полностью либо частично.
если вы в 2016 году работали, то у вас есть варианты замены (в зависимости от заработка): 2016-2014, 2013-2014.