Доброе утро. подскажите должна ли я еще работать 2 недели если сегодня напишу заявление по собственному желанию?

Да. и имейте ввиду, что для того чтобы не вылететь по статье за прогул день увольнения считается рабочим днем. его нужно обязательно отработать. если начальник упрется то не являясь 12 дней на работу (как вам советует ddk) вместо собственного желания ст. 80, в трудовой книжке вы можете получить пп "а" п. 6 ч. 1 ст. 81 трудового кодекса рф, это увольнение за прогул. согласно данной норме, прогул - это отсутствие сотрудника на рабочем месте без уважительных причин либо в течение всего рабочего дня, независимо от его продолжительности, либо более 4 часов подряд в течение рабочего дня. а это вряд ли украсит вашу трудовую, так и карьеру можно испортить