Я работаю уже 2года по договору.

В налоговую они идут. инн не является обязательным документом, который должны требовать при приеме не работу. ндфл перечисляется в налоговую одной общей суммой сразу по всем работникам, а "делится" конкретно на каждого только тогда, когда работодатель сдает в ифнс отчет по форме 2-ндфл.