Как часто налоговая проверяет трудовые договора?

Налоговая это не проверяет. Но каждая организация подлежит плановой проверке Трудовой инспекцией или по заявлению гражданина внеплановой. Вот тогда мало не покажется. Правда, работодатели почему-то ее не боятся совершенно. Я повсеместно сталкиваюсь с полным спокойствием работодателей, которые незаконно оформляют работников на срочные трудовые договоры вне ст. 59 ТК РФ и без ссылки на нее в тексте самого договора. Особенно грешат этим театры, учреждения культуры и прочее. Там даже для артистов предусмотрены постоянные ставки и для совместителей можно оформлять штатно. А рабовладельцы делают, что хотят. Вот для этого все организации и подлежат плановым проверкам. Жаль, что они заканчиваются очень мягко, а не показательными порками.