Правомерен ли заведующий вносить изменения в учебный процесс, если он некомпетентен в этом?

Заведующий филиалом школы уже неоднократно вносит свои критические замечания по ходу и методике ведения урока физической культуры. сама заведующая является учителем русского языка и литературы. школа сельская, детям кроме как по сельской дорожке около школы негде бегать короткие дистанции на уроках по легкой атлетике. за. филиалом запрещает это делать, но в тоже время дети самостоятельно и без запретов ходят по этой же дороге в школьную столовую- 200м. как быть учителю физ. культуры? нигде не бегать? бегать на стадионе, который не предназначен для этого ( ямки, кочки и трава высокая)? либо вообще ничего не делать? или есть другие варианты?