Добрый день , подскажите как уволиться с должности генерального директора?

Для этого надо смотреть ваш трудовой договор, где должна быть прописана эта ситуация. если же там эта ситация не прописана, то - на общих основаниях в соответствии с трудовым кодексом рф: подавайте заявление на имя вышестоящего руководителя, если предприятие государственное, или владельца (председателя правления, педседателя совета директоров, председателя общего собрания участников ооо и т.д.), если это предприятие частное.