Как лучше уволиться, получив инвалидность, по заболеванию или по собственному желанию?

Любая статья в ТК РФ не случайна. Если вы признаны ПОЛНОСТЬЮ НЕСПОСОБНЫМ к трудовой деятельности, то для вас есть п.5 части первой ст. 83 ТК РФ - увольнение в соответствии с медицинским заключением (в данном случае - по инвалидности). Во-первых это даст вам право на получение выходного пособия в размере двухнедельного среднего заработка (абзац пятый части третьей ст. 178 ТК РФ. Во-вторых увольнение (последний день работы) придётся именно на день, предшествующий дате получения инвалидности во всех случаях, даже если вы явитесь в отдел кадров намного позже этого срока, т.е факт прогула здесь исключён. А увольнение по собственному желанию, даже в день подачи заявления (ст. 80 ТК РФ) вам абсолютно ничего не даст.