Может ли фсс отказать в выплате декретных

Ну вообще- то платит пособие по бир работодатель, а фсс всего лишь навсего его возмещает. поскольку действия фсс в данном случае будут не законны и доказать "злой" умысел работодателя крайне не просто, то при обращении в суд выигрыш примерно 90%, а если хорошо подготовиться, то и более.
как правильно замечено выше:
статья 64. гарантии при заключении трудового договора
...запрещается отказывать в заключении трудового договора женщинам по мотивам, связанным с беременностью или наличием детей....
пленум верховного суда российской
федерации постановление от 28 января 2014 г. n 1 о применении законодательства,
регулирующего труд женщин, лиц с семейными обязанностями и несовершеннолетних
....3. под дискриминацией в сфере труда по смыслу статьи 1 конвенции международной организации труда 1958 года n 111 относительно дискриминации в области труда и занятий и статьи 3 тк рф следует понимать различие, исключение или предпочтение, имеющее своим результатом ликвидацию или нарушение равенства возможностей в осуществлении трудовых прав и свобод или получение каких-либо преимуществ в зависимости от любых обстоятельств, не связанных с деловыми качествами работника (в том числе не перечисленных в указанной статье трудового кодекса российской федерации), помимо определяемых свойственными данному виду труда требованиями, установленными федеральным законом, либо обусловленных особой заботой государства о лицах, нуждающихся в повышенной социальной и правовой защите.
в связи с этим в отношении женщин, лиц с семейными обязанностями и несовершеннолетних не допускаются различия при приеме на работу, установлении оплаты труда, продвижении по службе, установлении или изменении индивидуальных условий труда, подготовке (профессиональное образование и профессиональное обучение) и дополнительном профессиональном образовании, расторжении трудового договора и т. д., не основанные на деловых качествах работников, характеристиках условий их труда....