Что делать в этой ситуации?

Привлекать или не привлекать работника к взысканию ущерба - это право работодателя (но не обязанность). руководствуясь статьей 240 тк рф, работодатель имеет право с учетом конкретных обстоятельств, при которых был причинен ущерб, полностью или частично отказаться от его взыскания с виновного работника. собственник имущества организации может ограничить указанное право работодателя в случаях, предусмотренных федеральными законами, иными нормативными правовыми актами российской федерации, законами и иными нормативными правовыми актами субъектов российской федерации, нормативными правовыми актами органов местного самоуправления, учредительными документами организации. так что, только работодатель принимает решение о целесообразности иска.