Разбил стекло на рабочем авто. должен ли я платить за него?

Если это твоя вина, то должен. в данном случае ты не должен ничего менять и не должен платить и данное удержание будет незаконным.
жалуйся в гит и прокуратуру.
тк рф, статья 239. обстоятельства, исключающие материальную ответственность работника
материальная ответственность работника исключается в случаях возникновения ущерба вследствие непреодолимой силы, нормального хозяйственного риска, крайней необходимости или необходимой обороны либо неисполнения работодателем обязанности по обеспечению надлежащих условий для хранения имущества, вверенного работнику.
тк рф, статья 241. пределы материальной ответственности работника
за причиненный ущерб работник несет материальную ответственность в пределах своего среднего месячного заработка, если иное не предусмотрено тк рф или иными федеральными законами.